剛剛干燥完的麥芽不能用于啤酒生產，必須經過除根、貯藏后才能使用。干麥芽的處理包括除根、冷卻以及麥芽的磨光。冷卻步驟必須快速進行，以防因酶的破壞而致使麥芽色度上升和香味變壞。通過磨光可除去麥芽表面的水銹灰塵，提高麥芽的外觀質量。
1、冷卻
從干燥爐剛卸出的麥芽，溫度很高，必須要經過冷卻處理。這樣既可以減少昆蟲人侵的機會，也可以避免酶活性的降低，防止色澤和風味的變化。冷卻采用的方法包括通人低溫新鮮空氣和在低溫的冷卻容器(環境)中進行，使麥溫降至20℃左右。小型麥芽廠或制麥車間，可通過調節除根速度而冷卻麥芽。
2、除根
出爐麥芽中大多還帶有3%~4%的根芽。麥根中含有43%左右的蛋白質，有苦味，色澤很深，易吸水，不利于貯存，不但對麥汁制備毫無價值，而且還會影響啤酒的口味、色澤以及啤酒的非生物穩定性，所以根芽必須除去，此過程便稱為除根。
為了不延誤干燥爐作業周期，在除根機上方應設相當于每爐干麥芽2/3容積的暫存箱。除根機能力按每批干麥芽除根時間2~4h配置。麥芽排出口一般安裝套吸風設備，以除去灰塵及輕微雜質，同時對麥芽進行冷卻。
3、磨光
為除去附著在麥芽上的臟物和破碎的麥皮，使麥芽外觀更加漂亮，口味純正，麥芽廠可設置磨光機在麥芽出廠前處理麥芽。
麥芽磨光機主要由兩層傾斜篩面組成。第一層篩去大粒雜質，第二層篩去細小雜質，傾斜篩上方飛塵被旋風除塵器吸出。
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